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早期基督教时期，新约圣经问世后，教会流传着许多书籍和书信。教会逐渐形成共识，哪些作品为耶稣基督使徒（如马太、保罗或约翰）或其亲密伙伴（如路加或马可）所著。
然而，许多其他书籍在教会中流传，其内容和作者都存疑。这些书籍被称为伪经（源于希腊语“伪造的铭文”），不被主流宗教教派视为圣经正典。它们涵盖历史叙事、智慧寓言和文学元素等多种主题。
知名伪经
一些著名的伪经包括《托马斯福音》和《约翰秘密启示录》。这些书籍以及许多其他文本于1945年在埃及北部纳格哈马迪镇附近被发现，现藏于埃及开罗科普特博物馆的纳格哈马迪图书馆。在此之前，人们对许多书籍的了解仅限于批评家的观点和有限的引用。其他伪经还包括《以诺书》、《禧年书》和《摩西启示录》等。
奥利金评《托马斯福音》
亚历山大的基督教学者和神学家奥利金（185-254年）在编纂其历史著作时，并未将《托马斯福音》列入正典。然而，罗马的希波吕托斯（公元三世纪教会领袖）曾批判一个名为纳森派（Naassenes）的团体使用《托马斯福音》：
“关于（本性）这一点，他们引用了《托马斯福音》中一段明确的章节，他们这样表达：寻找我的人，将在七岁大的孩子身上找到我；因为在那里隐藏着，我将在十四岁时显现。然而，这不是基督的教诲，而是希波克拉底的教诲。”
公元四世纪杰出的神学家耶路撒冷的基里尔写道：
“新约只有四福音书，其余的都是虚假的标题和有害的。摩尼教徒也写了一部《托马斯福音》，它带有福音书名的香气，却败坏单纯之人的灵魂。”
批评者的视角：里昂的伊勒奈乌斯
在他的《驳异端》（公元180年）中，希腊主教里昂的伊勒奈乌斯谴责各种伪经和派别，特别是诺斯替教。事实上，我们今天对诺斯替教的大部分了解都来自伊勒奈乌斯的著作，因为他提供了对他们信仰的描述和批判。关于马可西派，他写道：
“……他们引用了无数的伪经和虚假的著作，这些著作是他们自己伪造的，目的是迷惑愚昧之人和那些不了解真理圣经的人的心灵。”
伊勒奈乌斯还谴责了《约翰秘密启示录》和《犹大福音》，以及可能由二世纪诺斯替教领袖瓦伦丁所著的《真理福音》。
对诺斯替教或类似文本的其他反对
除了广受严厉批评的《托马斯福音》以及伊勒奈乌斯对伪经和派别的明确谴责外，早期教会只保存了极少数诺斯替教文本。圣经历史上还有其他一些关于所谓的圣经“缺失”书籍的记载，但由于诺斯替教在公元300年代亚他那修写下《复活节信》（Vestal Letter），维护正典圣经并谴责其他书籍后迅速消亡，因此对其批判的记载也所剩无几。诺斯替教文本不像圣经其他书籍那样被反复抄写，因此逐渐消失，其信徒最终也逐渐消亡。
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